Как сделать вирус полезным для себя
О чем вы думаете, когда слышите слово «вирус»? «Надо защититься. Срочно бежать в аптеку за масками и витаминами». А всегда ли вирус так страшен и опасен, как мы о нем думаем? Может ли он быть полезен для человека?
Вирусы – неклеточные формы жизни. Почему неклеточные? Да потому что воспроизводиться и функционировать они могут исключительно внутри клеток. Без этой среды они принимают кристаллическую форму и перестают быть активными. Они могут поражать все живые организмы, включая растения и бактерии. Самостоятельно увидеть их невозможно, только через микроскоп. Вирусы, в сущности, нуклепротеиды, которые состоят из ДНК или РНК. Более сложные формы могут обладать оболочкой из липопротеина. Кроме обычных существуют вирусы-сателлиты – агенты, которым для существования нужно подспорье другого вируса. Такая своеобразная вирусная иерархия.
Чем опасны вирусы?
Давайте разберемся, как действует вирус. Проникая в организм, он поселяется в клетке. Поскольку вирус включает в себя нуклеиновые кислоты, он способен размножаться. Он вносит в клетку свою генетическую информацию. Это запускает процесс воспроизведения подобных агентов.
Простыми словами внутри клетки вырастает целая армия одинаковых вирусов, которые начинают разрушать ее изнутри. Белки вируса подавляют активность и жизненные функции клетки, она погибает. Все, что было в ней, расходится по организму. Инфекционные агенты заражают соседние клетки, в них все повторяется вновь. Иногда защитным механизмам организма удается удержать вирус внутри одной клетки. Там он как бы консервируется, дожидаясь своего часа.
Такие “консервные банки” – причина хронических заболеваний. Благодаря своему быстрому распространению вирусы становятся устойчивы к лекарствам, они развиваются, появляются новые штаммы заболеваний.
Как вирус попадает в организм?
Чаще всего вирусы передаются воздушно-капельным путем. Это вовсе не означает, что вирусы просто так существуют в воздухе, ведь мы с вами уже знаем, что им нужна определенная среда обитания. Однако если зараженный человек чихнет на вас или кашленет, то риск подхватить инфекционные агенты резко возрастает.
Существует путь с малоприятным названием «фекально-оральный». В этом случае вирус передается через зараженную еду или воду. Обычно так передается ротавирусная инфекция. Агенты обитают в желудочно-кишечном тракте и с радостью его покидают. Лучше не пить из одной кружки с больным человеком, сначала продезинфицируйте ее.
Еще один способ распространения вируса – через кровь. Мало какими заболеваниями можно заразиться через маленькую ранку, но вот через переливание крови – очень даже. Хорошо, что современные технологии и достижения медицины позволяют достаточно тщательно проверять донорскую кровь.
Последний, но один из самых частых, половой путь. Ежедневно более одного миллиона человек заражаются ЗППП (заболевания, передающиеся половым путем). Большинство из них протекают совершенно бессимптомно. Сюда относится хламидиоз, гонорея, сифилис, трихомониаз, герпес, вирус папиломы человека, ВИЧ, гепатит В и С и еще перечень заболеваний. В защите от ЗППП презервативы – лучшие друзья человека.
И что, все вирусы опасны?
Нет! Некоторые вирусы могут не просто соседствовать с человеком, но быть защитниками.
Бактериофаги поражают бактериальные клетки очень избирательно. Они живут на слизистых в пишеварительном, дыхательном и репродуктивном тракте. Фаги помогают имунной системе. Нередко их применяют для лечения золотистого стафилококка и сальмонеллеза. Иногда фаги способны подавить инфекцию, устойчивую даже к антибиотикам.
Полиднавирусы вирусы способны встраиваться в ДНК, поселяясь там навсегда. Они передаются потомкам, но уже не распространяются. В этот момент они перестают быть вредителями. Они несут в себе деффективные вирусные белки. Если в организм попадает схожий вирус, то эти самые белки мешают ему размножаться.
Вирусы Коксаки недавно ученые выяснили, что и этот вирус может принести пользу человеку. Эти вирусы передаются как через воду и еду, так и воздушно-капельным путем. Чаще всего болеют дети, взрослые более устойчивы к этим вирусам. Специалистам удалось вылечить рак мочевого пузыря. Эксперементальная группа состояла из 15 человек. Всех их намеренно заразили вирусом. У одного из пациентов агенты полностью уничтожили опухоль.
Все чаще вирусы применяют в медицине. Многие вакцины построены на агентах, которые утратили болезнетворные свойства, но все еще могут размножаться. Они создают “подушку безопасности”, строя барьер между своим носителем и такими же, но вредоносными, вирусами.
О чем вы думаете, когда слышите слово «вирус»? «Надо защититься. Срочно бежать в аптеку за масками и витаминами». А всегда ли вирус так страшен и опасен, как мы о нем думаем? Может ли он быть полезен для человека?
Вирусы – неклеточные формы жизни. Почему неклеточные? Да потому что воспроизводиться и функционировать они могут исключительно внутри клеток. Без этой среды они принимают кристаллическую форму и перестают быть активными. Они могут поражать все живые организмы, включая растения и бактерии. Самостоятельно увидеть их невозможно, только через микроскоп. Вирусы, в сущности, нуклепротеиды, которые состоят из ДНК или РНК. Более сложные формы могут обладать оболочкой из липопротеина. Кроме обычных существуют вирусы-сателлиты – агенты, которым для существования нужно подспорье другого вируса. Такая своеобразная вирусная иерархия.
Чем опасны вирусы?
Давайте разберемся, как действует вирус. Проникая в организм, он поселяется в клетке. Поскольку вирус включает в себя нуклеиновые кислоты, он способен размножаться. Он вносит в клетку свою генетическую информацию. Это запускает процесс воспроизведения подобных агентов.
Простыми словами внутри клетки вырастает целая армия одинаковых вирусов, которые начинают разрушать ее изнутри. Белки вируса подавляют активность и жизненные функции клетки, она погибает. Все, что было в ней, расходится по организму. Инфекционные агенты заражают соседние клетки, в них все повторяется вновь. Иногда защитным механизмам организма удается удержать вирус внутри одной клетки. Там он как бы консервируется, дожидаясь своего часа.
Такие “консервные банки” – причина хронических заболеваний. Благодаря своему быстрому распространению вирусы становятся устойчивы к лекарствам, они развиваются, появляются новые штаммы заболеваний.
Как вирус попадает в организм?
Чаще всего вирусы передаются воздушно-капельным путем. Это вовсе не означает, что вирусы просто так существуют в воздухе, ведь мы с вами уже знаем, что им нужна определенная среда обитания. Однако если зараженный человек чихнет на вас или кашленет, то риск подхватить инфекционные агенты резко возрастает.
Существует путь с малоприятным названием «фекально-оральный». В этом случае вирус передается через зараженную еду или воду. Обычно так передается ротавирусная инфекция. Агенты обитают в желудочно-кишечном тракте и с радостью его покидают. Лучше не пить из одной кружки с больным человеком, сначала продезинфицируйте ее.
Еще один способ распространения вируса – через кровь. Мало какими заболеваниями можно заразиться через маленькую ранку, но вот через переливание крови – очень даже. Хорошо, что современные технологии и достижения медицины позволяют достаточно тщательно проверять донорскую кровь.
Последний, но один из самых частых, половой путь. Ежедневно более одного миллиона человек заражаются ЗППП (заболевания, передающиеся половым путем). Большинство из них протекают совершенно бессимптомно. Сюда относится хламидиоз, гонорея, сифилис, трихомониаз, герпес, вирус папиломы человека, ВИЧ, гепатит В и С и еще перечень заболеваний. В защите от ЗППП презервативы – лучшие друзья человека.
И что, все вирусы опасны?
Нет! Некоторые вирусы могут не просто соседствовать с человеком, но быть защитниками.
Бактериофаги поражают бактериальные клетки очень избирательно. Они живут на слизистых в пишеварительном, дыхательном и репродуктивном тракте. Фаги помогают имунной системе. Нередко их применяют для лечения золотистого стафилококка и сальмонеллеза. Иногда фаги способны подавить инфекцию, устойчивую даже к антибиотикам.
Полиднавирусы вирусы способны встраиваться в ДНК, поселяясь там навсегда. Они передаются потомкам, но уже не распространяются. В этот момент они перестают быть вредителями. Они несут в себе деффективные вирусные белки. Если в организм попадает схожий вирус, то эти самые белки мешают ему размножаться.
Вирусы Коксаки недавно ученые выяснили, что и этот вирус может принести пользу человеку. Эти вирусы передаются как через воду и еду, так и воздушно-капельным путем. Чаще всего болеют дети, взрослые более устойчивы к этим вирусам. Специалистам удалось вылечить рак мочевого пузыря. Эксперементальная группа состояла из 15 человек. Всех их намеренно заразили вирусом. У одного из пациентов агенты полностью уничтожили опухоль.
Все чаще вирусы применяют в медицине. Многие вакцины построены на агентах, которые утратили болезнетворные свойства, но все еще могут размножаться. Они создают “подушку безопасности”, строя барьер между своим носителем и такими же, но вредоносными, вирусами.
В наши дни кибервойн и кибермафии трудно даже вспомнить те времена, когда компьютерные вирусы и черви были лишь исследовательскими проектами или инструментами дурацких розыгрышей. Тогда не было особых финансовых стимулов писать вредоносное ПО, и не каждый вирусописатель был злым. Поэтому некоторые программисты изучали возможность написания «полезных» вирусов или старались минимизировать негативное воздействие своих вирусов на компьютер. В редких случаях вирусы даже устраняли с компьютера экземпляры других опасных программ или оптимизировали ресурсы ПК. Давайте вспомним пять самых интересных «пользоносных» (как антоним вредоносным) программ.
5. The Creeper (1971)
Первый в истории действующий компьютерный вирус был больше академическим исследованием и, как и стоит ожидать в таком случае, был в целом безвреден. Он назывался Creeper («Ползун») и был создан более 40 лет назад сотрудником американского оборонного агентства DARPA (Defense Advanced Research Projects Agency). Это был примитивный червь, который искал в сети другие компьютеры (а сети тогда были локальными и небольшими) и копировал себя на новые машины. На «старой» зараженной машине выводилось сообщение: «I’M THE CREEPER: CATCH ME IF YOU CAN» («Поймай меня, если сможешь»), а на новой вирус проверял наличие своей копии, чтобы избежать двойного заражения.
4. Stoned (1988)
Известный «шуточный» вирус Stoned («Под кайфом») был написан для того, чтобы показать встроенное послание пользователю. Впервые Stoned был обнаружен в 1988 году в Новой Зеландии, где его предположительно написали местные студенты. Это был бут-вирус, который модифицировал загрузочные секторы дискет вместо заражения исполняемых файлов. Как и Creeper, он не вредил компьютеру. При загрузке с зараженной дискеты с вероятностью 1 к 8 на экран выводилось сообщение: «Your computer is now stoned», то есть «Ваш компьютер под кайфом». Некоторые экземпляры содержали более четкий призыв к действию: «Legalize Marijuana». Похоже, это сообщение достигло желаемых адресатов (а именно политиков в США, штат Колорадо) только в 2012 году.
3. HPS (1997)
Звание «вируса для розыгрышей» заслуженно уходит создателям HPS, программы, по идее разработанной для Windows 98, но запущенной в мир гораздо раньше этой ОС. Хулиганская функциональность HPS активировалась по субботам — вирус искал на диске несжатые BMP-картинки и зеркально отображал их. Поскольку Windows активно использовала BMP-графику, это приводило к различным спецэффектам вроде отображения экрана запуска и выключения Windows в зеркальном виде.
2. The Cruncher (1993)
Cruncher был типичным «резидентным» (то есть постоянно работающим) вирусом 90-х. Он заражал исполняемые файлы, а затем использовал украденный в программе DIET алгоритм для сжатия приложений. В результате зараженный файл обычно был короче, чем оригинальный, оставаясь при этом работоспособным. Это освобождало место на винчестере пользователя.
Вообще предполагается, что Cruncher таким способом просто пытался спрятаться от антивирусов, но побочный эффект был приятен по тем временам.
1. Welchia, он же Nachi (2003)
На конкурсе «Самый полезный червь» Welchia явно претендует на первое место.
Тогда, в 2003 году, персональные файрволы и регулярные обновления приложений не были общепринятой практикой. Поэтому заразить свой компьютер вирусом можно было, просто включив в него кабель компьютерной сети. Осуществить такой трюк вирусописателям помогали серьезные уязвимости в сетевых компонентах Windows. Одним из самых распространенных червей, основанных на этой уязвимости, был Lovesan, он же Blaster, кратковременно парализовавший работу некоторых компаний на пике своего распространения в августе 2003 года. Welchia использовал те же уязвимости для заражения компьютера, но дальнейшие действия червя были крайне необычны. Он проверял, нет ли на компьютере вируса Blaster. При его обнаружении он удалял червя из памяти и с диска, но не останавливался на этом. Далее «услужливый вирус» пытался скачать обновление с сайта Microsoft, устраняя таким образом дыру, через которую Blaster и он сам могли попасть в систему. После этих операций Welchia самоуничтожался.
Сегодня почти 100% вирусов создаются с единственной целью — кража денег и конфиденциальных данных.
Не поймите превратно — даже безвредные или «полезные» вирусы являются крайне нежеланными гостями на ваших устройствах. Они в определенных условиях могут причинить вред из-за ошибки программиста, и даже он сам не сможет исправить ошибку, поскольку распространение вируса более им не контролируется. Даже самые ванильно-безвредные программы вредны уже тем, что без толку потребляют ресурсы компьютера. Впрочем, сама концепция «безвредного вредоносного ПО» в наши дни уже неактуальна.
«Сегодня почти 100% вирусов создаются с единственной целью — кража денег и конфиденциальных данных», — сказал Александр Гостев, главный антивирусный эксперт «Лаборатории Касперского».
«Что нас не убивает, делает нас сильнее» — вот уж точно лучший эпиграф к книге Шарома Моалема «А что, если они нам не враги? Как болезни спасают людей от вымирания», русский перевод которой выпустило издательство «Бомбора». В ней американский врач и ученый объясняет, что болезни, вирусы и даже живущие в нас паразиты хоть и опасны, но сослужили человечеству добрую службу. «РБК Стиль» публикует отрывок из книги, рассказывающий, какую роль в нашей жизни играют вирусы.
Может быть, вы и думаете о вирусах каждый день — по крайней мере о том, как их избежать, будь то вирусы компьютерные или биологические, — однако вы наверняка давненько не читали о них в книгах по биологии, поэтому сейчас мы быстренько освежим ваши познания о них. Вирусы представляют собой фрагменты генетического кода, неспособные к самостоятельному размножению. Единственный способ размножения вирусов — это заражение другого организма с целью использования его клеточных механизмов в своих целях.
Вирусы могут успеть размножиться много тысяч раз внутри одной клетки, прежде чем прорвут ее стенки и перейдут к захвату следующей клетки. Большинство ученых не считают вирусы «живыми» из-за отсутствия у них обмена веществ и способности к самостоятельному размножению.
Ретровирусы представляют собой довольно особую разновидность вирусов. Чтобы понять, что в этих вирусах такого важного, следует сначала уяснить, как именно используется генетическая информация для построения клеток и в конечном счете целых организмов. Если в общих чертах, то строительство организма происходит по следующему пути: от ДНК к РНК и от РНК к белкам. Представьте себе, что ДНК — это библиотека, содержащая чертежи целого города, а клетки нашего тела — различные здания этого города: школы, муниципальные здания, жилые дома, гостиницы и т.д. Когда у организма возникает потребность построить новое здание, он использует для этих целей вспомогательный фермент под названием «РНК-полимераза», чтобы скопировать чертежи этого здания на матричную РНК — мРНК. мРНК относит эти чертежи на стройплощадку и руководит постройкой заказанного здания, или белка.
На протяжении долгого времени ученые были уверены, что генетическая информация способна перемещаться только в этом направлении: от ДНК к РНК и от РНК к белку. Открытие ретровирусов — таких как ВИЧ — доказало, что они были не правы. Ретровирусы состоят из РНК. С помощью фермента под названием «обратная транскриптаза» ретровирусы синтезируют ДНК на матрице своей РНК — происходит изменение направления информационного потока. Если следовать нашей аналогии с городом, то это равносильно изменению оригинальных чертежей, вместо того чтобы просто копировать их и переносить полученные копии. У этого процесса существуют серьезнейшие последствия — ретровирусы способны буквально изменять ДНК человека, так как могут встраиваться в его геном.
Открытие РНК, способных трансформироваться в ДНК, привело к открытию новых лекарств, ставших основой современной комбинированной антиретровирусной терапии, применяемой для лечения ВИЧ-инфекции.
Подобно противооткатному упору (в простонародье известному как «башмак»), который водители подкладывают под колеса своих грузовиков, чтобы те не сдвинулись с места, некоторые из этих лекарств останавливают фермент обратной транскриптазы, в результате чего ВИЧ оказывается запертым в пределах своей внутриклеточной стоянки: он пытается забраться в ДНК клетки, но не может его достичь.
Теперь представьте себе, что происходит, когда ретровирус или вирус записывает свой генетический код в ДНК зародышевой клетки организма. Потомки этого организма рождаются с вирусом, навечно запечатанным в их ДНК.
Разумеется, чаще всего, как это происходит со всеми мутациями, при рождении потомков с измененной ретровирусом в зародышевых клетках одного из родителей ДНК, внесенное изменение оказывается вредоносным, и оно не задерживается в генофонде. Но если вирус не приносит никакого вреда, а то и вовсе повышает шансы потомков выжить и размножиться, то он может в конечном счете навсегда прописаться в генофонде.
ДНК — это библиотека, содержащая чертежи целого города, а клетки нашего тела — различные здания этого города: школы, муниципальные здания, жилые дома, гостиницы.
Если генетический код, изначально принадлежавший вирусу, становится частью генома организма, то они, по сути, становятся единым целым.
На сегодняшний день нам достоверно известно, что геном человека по меньшей мере на 8% состоит из ретровирусов и родственных им элементов, навсегда обосновавшихся в нашей ДНК, — их называют эндогенными ретровирусами человека, или HERV. Ученые только начинают постигать роль HERV в здоровье людей, однако они уже обнаружили весьма любопытные закономерности. Так, проведенное исследование показало, что один вид HERV может играть важную роль в образовании здоровой плаценты, а другое продемонстрировало наличие связи между эндогенными ретровирусами и заболеванием кожи под названием «псориаз».
Шустрые прыгающие гены тоже могут быть потомками вирусов. Выделяют два основных типа прыгающих генов — гены первого типа под названием «ДНК-транспозоны» прыгают, используя механизм «вырезать и вставить», в то время как второй тип, ретротранспозоны, используют для своих прыжков механизм «копировать и вставить». Оказывается, что прыгающие гены второго типа — ретротранспозоны — чертовски похожи на ретровирусы. В этом есть свой смысл, потому что используемый ими механизм «копировать и вставить» очень похож на механизм, применяемый ретровирусами. Сначала ретротранспозоны копируют себя в РНК, как это делают любые нормальные гены, затем, когда РНК доходит до того места в геноме, в котором эти прыгуны хотят приземлиться, ретротранспозоны с помощью обратной транскрипции вставляют себя в ДНК, изменяя привычное направление информационного потока, точно так же, как это делают и ретровирусы.
Никто не верит в силу вирусного маркетинга так, как Луис Вильярреал. Он убежден, что ничто на свете не способно так быстро распространять информацию, проникать во все живое и существовать настолько долго, как вирусы. Вильярреал является директором Центра исследования вирусов при Калифорнийском университете в Ирвине, и он досконально изучил последствия вирусного воздействия на эволюцию человека.
Вильярреал отдает должное Сальвадору Лурия, микробиологу, ставшему лауреатом Нобелевской премии, занимавшемуся научными исследованиями с сороковых по восьмидесятые годы прошлого века, за сделанное им предположение о том, что вирусы помогли положить начало эволюции человечества не снаружи, а изнутри. В 1959 году Лурия написал, что вклинивание вирусов в геном могло привести к созданию «успешного генетического шаблона, который лег в основу всех живых клеток».
Ничто на свете не способно так быстро распространять информацию, проникать во все живое и существовать настолько долго, как вирусы.
Вильярреал предположил, что эта идея приживалась достаточно долго по той причине, что у людей возникает чувство внутреннего отвращения, когда они слышат о том, что наша эволюция была спровоцирована паразитами: «В человеческой культуре неизбежно возникает сильная негативная реакция на все, что связано с паразитами. Ирония в том, что это настолько важная творческая сила… Если хочешь эволюционировать, приходится мириться с заражением паразитами».
В своей книге «Вирусы и эволюция жизни», опубликованной в 2005 году, Вильярреал говорит о том, что настало время по-новому взглянуть на вирусы. Вильярреал проводит различие между такими хорошо известными смертельными паразитами, как ВИЧ и вирус оспы и, как он их назвал, «устойчивыми вирусами». Под устойчивыми вирусами ученый подразумевает те, что мигрировали в наш геном миллионы лет назад, став нашими партнерами по эволюции.
То, какую пользу извлекли вирусы, навсегда поселившись в нашем геноме, очевидно — они стали жить за счет нас. Но какой прок был от этого нам? Что ж, вирусы в совершенстве владеют искусством мутации — они представляют собой огромнейший склад генетических возможностей, которые реализуются ими невероятно быстро — они мутируют в миллионы раз быстрее, чем мы.
Чтобы донести до людей то, насколько громаден генетический потенциал мира вирусов, Вильярреал часто просит людей попробовать представить себе все вирусы в Мировом океане — а их там ни много ни мало 100000000000000000000000000000 (если вы пытаетесь сосчитать, то это сто нониллионов). Эти крошечные контейнеры с генетическим кодом имеют микроскопические размеры, но, если выложить их все в ряд, получится цепочка длиной в десять миллионов световых лет. Вильярреал называет вирусы величайшими генетическими творцами, изобретающими огромное количество новых генов, некоторые из которых просачиваются в геном их носителей.
Происходит это следующим образом. Устойчивым вирусам в геноме человека наше выживание и размножение выгодно не меньше, чем нам самим — являясь частью нашей ДНК, они эволюционно заинтересованы в нашем успехе. Последние несколько миллионов лет вирусы, возможно, жили только за наш счет, в обмен на это позволив позаимствовать немного генетического кода из их внушительной генетической библиотеки. Благодаря своим возможностям для мутации вирусы неизбежно натыкаются на полезные гены намного быстрее, чем это бы происходило у нас без их помощи. В конечном счете такое взаимовыгодное сотрудничество с вирусами могло бы позволить нам эволюционировать и стать сложным организмом гораздо быстрее, чем мы это делаем сами.
Исследования прыгающих генов предоставили наглядные доказательства теории Вильярреала. Итак, прыгающие гены, скорее всего, произошли от вирусов. Как оказалось, чем сложнее живой организм, тем больше у него прыгающих генов. У человека и родственных ему африканских приматов даже есть особенный генетический признак, облегчающий нашему геному заключать сделки с вирусами. Какой-то отдельный ретровирус изменил наш геном так, чтобы в него было проще проникать другим ретровирусам. По мнению Вильярреала, способность приматов поддерживать заражение устойчивыми вирусами могло «ускорить» нашу эволюцию — если бы на наш геном стало воздействовать больше ретровирусов и процесс мутации ускорился. Возможно, именно это явление стимулировало появление в ходе эволюции современных людей.